A AG 101 (el 101è any del calendari de la generació avançada), una misteriosa entitat coneguda només com a "UE", o "enemic desconegut", ataca i destrueix la colònia espacial Àngel. Aquest brutal atac es fa famós com "El dia que va caure l'àngel" i marca el començament de la guerra per la supervivència de la humanitat. La sèrie comença a l'AG 108 quan la UE ataca la colònia espacial Ovan, on ara viu Flit Asuno després d'escapar de la colònia Angel abans de la seva destrucció. La mare de Flit poc abans de ser assassinada per la UE, dóna al seu fill un objecte anomenat "Dispositiu AGE". Al seu interior descobreix els plànols d'una arma poderosa del passat: l'antic messies anomenat "Gundam".
A partir d’aquests plànols, Flit passa els propers anys estudiant enginyeria en una base de la Federació de la Terra a la colònia espacial Nora i dissenyant el Gundam AGE-1. Set anys després, a l'AG 115, Flit completa el Gundam AGE-1 Normal, just quan la UE ataca Nora, i en fa ús per ajudar la tripulació del cuirassat de la Federació "Diva" a evacuar els ciutadans de la colònia abans que sigui destruïda. Decidit a portar la batalla a la UE per haver destruït dues vegades la seva casa, Flit accepta servir al grup de vestits mòbils de Diva pilotant el Gundam. Després d’obtenir prou dades i poder militar per establir un curs d’acció, la tripulació de Diva i els seus aliats llancen un atac amb èxit que va destruir la fortalesa secreta de la UE a l’asteroide Ambat. Allà s’assabenten que els UE són en realitat els descendents d’una missió humana suposadament fallida enviada per colonitzar Mart, deixada per mort per la Federació de la Terra, que va formar la seva pròpia nació al planeta vermell anomenat Veigan.
